ハカセのあやしい研究ノート

いつかはかせになるひとへ

2018-08-17から1日間の記事一覧

AmberのCPPTRAJで二次構造を調べる方法

研究メモ。 今日はAmberのCPPTRAJでタンパク質の二次構造を調べたい。 二次構造とはαヘリックスやβシートなどのこと。 参考 Amber16のマニュアル http://ambermd.org/doc12/Amber16.pdf 状況 例えばあるタンパクのフォールディングをMDシミュレーションでや…