2018-06-01から1日間の記事一覧

AmberのCPPTRAJで水素結合を調べる方法

研究メモ。 AmberでMDやった後、CPPTRAJで解析したいとき 参考: CPPTRAJ Hydrogen Bond Analysis Tutorial http://ambermd.org/doc12/Amber14.pdf (Amber14のマニュアル。重い…) とりあえず水素結合ってのはタンパク質の構造にとって重要で、FON(フッ素・…